More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4671 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1111 aa  2256    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1219 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1219 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1135 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1136 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 1237 aa  413  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1114 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1037 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1161 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1119 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 1038 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1155 aa  360  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1027 aa  358  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1114 aa  357  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1059 aa  356  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1124 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1023 aa  355  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1161 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1051 aa  350  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1006 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.01 
 
 		 1063 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 1000 aa  346  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 1029 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 1043 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1038 aa  340  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1076 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  28.45 
 
 		 925 aa  338  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 1211 aa  338  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1010 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1008 aa  337  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1077 aa  337  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1020 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1154 aa  336  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1101 aa  333  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 999 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1076 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1117 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1177 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.81 
 
 		 1041 aa  331  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  27.44 
 
 		 1024 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1006 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1155 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1028 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1039 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1050 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  27.96 
 
 		 1030 aa  323  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 1014 aa  323  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1071 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1066 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1132 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1075 aa  321  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1220 aa  320  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1076 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 1035 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 1023 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1006 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1218 aa  318  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1181 aa  314  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1185 aa  314  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1189 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1053 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1012 aa  313  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1160 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 986 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1122 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1040 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 996 aa  310  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1181 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1079 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1229 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 1049 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1152 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1127 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1023 aa  307  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1036 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1021 aa  306  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1198 aa  306  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1060 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1034 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1039 aa  304  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1105 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1037 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 1080 aa  301  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 1080 aa  301  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 982 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1062 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1106 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  26.56 
 
 		 1019 aa  299  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1047 aa  299  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 1094 aa  299  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 986 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1064 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1019 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1049 aa  298  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1119 aa  298  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 1003 aa  297  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1079 aa  297  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1008 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1028 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 975 aa  296  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>