More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0305 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  42.35 
 
 		 1237 aa  946    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  45.94 
 
 		 1114 aa  996    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  56.77 
 
 		 1135 aa  1250    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1219 aa  2481    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  53.33 
 
 		 1219 aa  1256    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  55.47 
 
 		 1119 aa  1174    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  57.26 
 
 		 1136 aa  1269    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  30.23 
 
 		 1111 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1220 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1140 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1129 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1160 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 1185 aa  357  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1154 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1203 aa  352  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1132 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1124 aa  348  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1161 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1204 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1062 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1127 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1205 aa  338  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1010 aa  333  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  25.67 
 
 		 1211 aa  327  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1120 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 1181 aa  323  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 1189 aa  322  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 1198 aa  321  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1114 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1109 aa  317  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1199 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1163 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1218 aa  307  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 1122 aa  304  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1144 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1096 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1198 aa  300  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 1154 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1006 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1131 aa  298  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1017 aa  298  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1034 aa  298  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1113 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1113 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 1014 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 996 aa  292  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1043 aa  290  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1154 aa  290  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 1026 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 994 aa  288  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1116 aa  288  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 1037 aa  288  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1066 aa  287  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1096 aa  287  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 1029 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1181 aa  287  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 999 aa  287  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1079 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 989 aa  285  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 1080 aa  284  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1050 aa  284  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1138 aa  284  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1175 aa  281  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1053 aa  279  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1049 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1202 aa  278  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1000 aa  278  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 1023 aa  277  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1071 aa  277  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1229 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1105 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1192 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 1158 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 992 aa  275  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1137 aa  274  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1040 aa  274  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 1003 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1230 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1008 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1076 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1039 aa  273  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 1168 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1106 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1146 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 996 aa  268  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1024 aa  265  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1039 aa  264  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1010 aa  264  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.65 
 
 		 1019 aa  264  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1025 aa  264  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1036 aa  263  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1013 aa  262  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 986 aa  259  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1014 aa  258  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1094 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1063 aa  258  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 1090 aa  257  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1028 aa  257  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1187 aa  257  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1023 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>