More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1036 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1096 aa  2224    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 1199 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  42.08 
 
 		 1175 aa  754    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 1190 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 1181 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  36.39 
 
 		 1187 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1230 aa  542  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1085 aa  528  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1189 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1218 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1161 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 1185 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1203 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1229 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1204 aa  337  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1198 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1202 aa  327  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 1211 aa  323  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1205 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1101 aa  290  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1219 aa  287  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 1198 aa  278  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 		 1111 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1219 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1135 aa  238  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1028 aa  234  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1027 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1136 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 1132 aa  212  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.95 
 
 		 1237 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1010 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1114 aa  201  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1119 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 1029 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  22.96 
 
 		 1077 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 1086 aa  188  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1003 aa  187  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 1017 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1023 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 979 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 1143 aa  184  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1106 aa  184  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  23.47 
 
 		 1057 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 1025 aa  182  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1102 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1079 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  24.88 
 
 		 1018 aa  179  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 1034 aa  177  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 1168 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 994 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1137 aa  175  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1076 aa  174  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1014 aa  174  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  24.54 
 
 		 1041 aa  173  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1018 aa  172  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1050 aa  172  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1038 aa  172  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1181 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 1128 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 1037 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 1150 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1177 aa  167  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1024 aa  167  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1122 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1119 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1039 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  22.91 
 
 		 1012 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 1036 aa  162  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  24.13 
 
 		 1047 aa  161  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1148 aa  161  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1028 aa  160  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 1050 aa  159  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 1220 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 1144 aa  157  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1051 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1023 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.43 
 
 		 925 aa  155  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1070 aa  154  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 1146 aa  154  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 975 aa  153  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  22.57 
 
 		 1125 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 994 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 1152 aa  152  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 1006 aa  152  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 1059 aa  151  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1036 aa  150  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 1158 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 1038 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  23.42 
 
 		 1127 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1021 aa  149  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1147 aa  148  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 1033 aa  148  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  23.49 
 
 		 1017 aa  147  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1006 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 		 1079 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 1036 aa  147  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 996 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 1148 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 1089 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 1172 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>