More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0185 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0185  ragA protein  100 
 
 		 1017 aa  2092    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 1018 aa  563  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1013 aa  511  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 1037 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1028 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1027 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1071 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1006 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1023 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1008 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1116 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1155 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1029 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1177 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1155 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1051 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 982 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 992 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1082 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1161 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1060 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 1038 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1012 aa  366  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1010 aa  363  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1006 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1041 aa  360  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 996 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1038 aa  360  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1114 aa  360  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 989 aa  359  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1062 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1066 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 1014 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1026 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1117 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1076 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  28.66 
 
 		 925 aa  353  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 1023 aa  350  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1039 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1023 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1064 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1043 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1173 aa  348  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1181 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 994 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1066 aa  346  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1062 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1050 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1008 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1076 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1021 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 997 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 1000 aa  341  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1132 aa  341  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.64 
 
 		 1019 aa  341  5e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1076 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1147 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1102 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 1140 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1079 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1119 aa  337  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.79 
 
 		 1041 aa  337  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 999 aa  337  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.33 
 
 		 1024 aa  337  9e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1019 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1026 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 986 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 986 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1039 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1051 aa  332  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1124 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1144 aa  328  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 1080 aa  327  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1079 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1128 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 975 aa  326  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  27.99 
 
 		 1030 aa  325  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1025 aa  324  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1085 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1024 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 1043 aa  320  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1148 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 1071 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1161 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1130 aa  318  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1028 aa  317  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1053 aa  317  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1006 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1033 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1097 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1125 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1086 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1017 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1122 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1077 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1036 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1154 aa  311  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1034 aa  311  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 1119 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>