More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0269 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  54.24 
 
 		 1013 aa  1114    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1018 aa  2089    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  36.45 
 
 		 1017 aa  563  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1120 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1077 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1008 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1027 aa  364  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1010 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1006 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 982 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1051 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1026 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1023 aa  351  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 997 aa  350  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1181 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 992 aa  349  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1006 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 989 aa  347  5e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1043 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1037 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 994 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 1014 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 1119 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 999 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1161 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1012 aa  340  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1020 aa  338  3.9999999999999995e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1038 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1033 aa  337  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1116 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1039 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 975 aa  334  6e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 1050 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.77 
 
 		 1041 aa  332  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1041 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 994 aa  331  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1129 aa  330  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1028 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1079 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 979 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1024 aa  328  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 1023 aa  327  5e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 		 1080 aa  327  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1079 aa  327  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1155 aa  327  9e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 1035 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.57 
 
 		 1019 aa  325  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1049 aa  324  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 1043 aa  324  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1140 aa  324  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 986 aa  324  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.55 
 
 		 925 aa  323  9.000000000000001e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1082 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1029 aa  322  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1053 aa  321  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1155 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 1071 aa  321  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1060 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1083 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1189 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1021 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1114 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1164 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  28.83 
 
 		 1002 aa  318  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 1038 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 996 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1124 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1085 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1132 aa  313  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1154 aa  313  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1096 aa  313  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1147 aa  312  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1096 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1084 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1062 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1017 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1064 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1013 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1152 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1026 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1127 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1177 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1040 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1004 aa  307  7e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1102 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1116 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1103 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1076 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1154 aa  304  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 1028 aa  303  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1071 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1066 aa  301  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1051 aa  301  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1034 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1058 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 1034 aa  299  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1041 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1062 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1096 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 1065 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>