More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7271 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  60.24 
 
 		 1175 aa  1325    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1084 aa  2215    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  62.92 
 
 		 1202 aa  1357    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  59.65 
 
 		 1189 aa  1278    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 1083 aa  788    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  40.04 
 
 		 1064 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  39.8 
 
 		 1085 aa  707    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1082 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  40.27 
 
 		 1077 aa  765    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 1062 aa  720    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  44.26 
 
 		 1060 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  41.01 
 
 		 1096 aa  782    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 1036 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1052 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.82 
 
 		 1008 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 1177 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1164 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1161 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 1006 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 1020 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1116 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1012 aa  494  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1192 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1177 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.56 
 
 		 1023 aa  485  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1038 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1006 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1010 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1128 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 1047 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 1026 aa  477  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 		 1051 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1066 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1179 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  32.36 
 
 		 1005 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1034 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1181 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1155 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 989 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 		 1043 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1049 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1079 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1029 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1020 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1055 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 986 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1017 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1130 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 1033 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 994 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1076 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1065 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1003 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.49 
 
 		 1063 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1140 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1026 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1075 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1139 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1129 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1148 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 1010 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1050 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1117 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1004 aa  436  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1039 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 1019 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1168 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1076 aa  433  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1036 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1076 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 996 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.58 
 
 		 1002 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1124 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1071 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1103 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1031 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1039 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1150 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1119 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1155 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 1011 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 1041 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1173 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1128 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1127 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 999 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1081 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1028 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1116 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1027 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 1041 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1031 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1034 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1079 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1023 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 1014 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1025 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1147 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>