More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1802 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  62.84 
 
 		 1172 aa  1353    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  37.34 
 
 		 1066 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  70.73 
 
 		 1137 aa  1558    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1119 aa  2273    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 		 1177 aa  629  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1155 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.89 
 
 		 1071 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1181 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 1173 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 1079 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  35.99 
 
 		 1161 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1038 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 1050 aa  556  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 1037 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 1071 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1114 aa  539  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1122 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1128 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 		 1081 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1023 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1124 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 1029 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1148 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1164 aa  513  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  33.91 
 
 		 1097 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 986 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  33.13 
 
 		 1060 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 982 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1008 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 989 aa  499  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1079 aa  502  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1117 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1039 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1006 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.07 
 
 		 1041 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1012 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.06 
 
 		 1064 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1071 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1116 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1132 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1058 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1066 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1051 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 1020 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1082 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1052 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1039 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1038 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 1026 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1163 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 1177 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1036 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 1051 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1028 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.21 
 
 		 1023 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 1128 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 1000 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.46 
 
 		 1063 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1076 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1129 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1155 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1152 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1076 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 1019 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1096 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1033 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1192 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1085 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1027 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1140 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1139 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 994 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 1080 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1103 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 1025 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1154 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1006 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 996 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1150 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1075 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1020 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  30.97 
 
 		 1080 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1059 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 1161 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1084 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1023 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  31.5 
 
 		 1005 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 1011 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1010 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 999 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1060 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1026 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1076 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1062 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 1063 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  30.47 
 
 		 1002 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1023 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1003 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1036 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>