More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4497 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  43.66 
 
 		 1203 aa  932    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  39.5 
 
 		 1189 aa  793    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1198 aa  2459    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1218 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1229 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1175 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1187 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1199 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 1181 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1230 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1161 aa  400  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 1198 aa  396  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 1190 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1202 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 1185 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1204 aa  343  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1205 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  26.36 
 
 		 1211 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1096 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1219 aa  300  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1220 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1085 aa  291  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1219 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1136 aa  280  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1150 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1086 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 1154 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1109 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.58 
 
 		 1237 aa  246  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1154 aa  242  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1135 aa  241  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.39 
 
 		 1111 aa  236  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1028 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 1114 aa  234  7.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 1158 aa  234  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1124 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1101 aa  224  6e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1006 aa  224  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1148 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1059 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1008 aa  214  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  25.1 
 
 		 925 aa  214  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1163 aa  212  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1013 aa  211  9e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1152 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1161 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1092 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1028 aa  204  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 1051 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 994 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 1160 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1113 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1139 aa  198  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1119 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.17 
 
 		 1019 aa  195  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1023 aa  194  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 1155 aa  194  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1039 aa  193  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 1164 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1034 aa  187  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 1117 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1154 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1101 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1116 aa  185  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  24.73 
 
 		 1011 aa  184  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.01 
 
 		 1147 aa  183  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1106 aa  183  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 982 aa  181  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1080 aa  178  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1023 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 1138 aa  175  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1077 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1125 aa  174  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 999 aa  174  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1127 aa  173  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 1028 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  22.33 
 
 		 1114 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1119 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1173 aa  168  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1146 aa  168  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1105 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1089 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1047 aa  164  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1127 aa  163  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  23.47 
 
 		 1103 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1101 aa  162  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1169 aa  161  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1129 aa  161  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1132 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 894 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 1140 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1064 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  23.88 
 
 		 1084 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 1006 aa  159  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1066 aa  158  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1033 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1089 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 1128 aa  157  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 1098 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1062 aa  156  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>