More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6733 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  42.35 
 
 		 1153 aa  793    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  45.37 
 
 		 1010 aa  846    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1098 aa  2220    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  37.7 
 
 		 1129 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  41.12 
 
 		 1041 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  39.71 
 
 		 1008 aa  662    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  38.63 
 
 		 1028 aa  619  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 1127 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  37.75 
 
 		 1063 aa  619  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  35.75 
 
 		 1059 aa  571  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  37.66 
 
 		 1031 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 1105 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 1093 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.01 
 
 		 1065 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1169 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1074 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1135 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1059 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1153 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1166 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1065 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1063 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1142 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1147 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 962 aa  462  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1038 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1138 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.15 
 
 		 1058 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1022 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1163 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  32.47 
 
 		 1032 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1165 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1081 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  31.3 
 
 		 1051 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1064 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1040 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1050 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1081 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1068 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1043 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1102 aa  413  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1186 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  30.72 
 
 		 1071 aa  412  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1033 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1088 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1036 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1073 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1059 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1033 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1047 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1043 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1087 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1051 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1072 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1011 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1071 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1067 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 1078 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1073 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1189 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.81 
 
 		 1083 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1137 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 1234 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1039 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1107 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1027 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1176 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1138 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1115 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1044 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1081 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.05 
 
 		 1025 aa  345  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1098 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1071 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1057 aa  332  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1088 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1084 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1099 aa  320  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1124 aa  314  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1116 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1163 aa  303  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 1128 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1094 aa  269  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1140 aa  268  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1127 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1097 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1102 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1043 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.62 
 
 		 1132 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1122 aa  257  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 986 aa  254  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 1029 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1027 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1066 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1155 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1109 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1040 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1154 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1086 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>