More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2264 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1175 aa  2415    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  39.45 
 
 		 1199 aa  765    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 1190 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1187 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  37.09 
 
 		 1181 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  42.08 
 
 		 1096 aa  754    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1230 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1085 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 1189 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1203 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1218 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1198 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1161 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 1185 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1229 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1198 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1204 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1202 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 1211 aa  336  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1205 aa  333  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1101 aa  313  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1219 aa  285  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1219 aa  279  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1062 aa  265  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1135 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 1111 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1136 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 1119 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1010 aa  241  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  23.41 
 
 		 1237 aa  237  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1027 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1160 aa  235  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1220 aa  234  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1132 aa  231  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 1128 aa  227  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1158 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1023 aa  222  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1154 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1119 aa  217  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1106 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 994 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 986 aa  208  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1161 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 1050 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 996 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  22.9 
 
 		 1109 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1102 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 1119 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 1086 aa  197  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 		 1146 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 1109 aa  194  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 992 aa  194  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1051 aa  194  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 1096 aa  194  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1017 aa  194  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 1127 aa  192  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1144 aa  191  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 1034 aa  191  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 1114 aa  189  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 1152 aa  189  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 1043 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  22.95 
 
 		 1168 aa  186  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 994 aa  185  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1096 aa  183  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1012 aa  181  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1023 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1062 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1037 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1006 aa  181  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 1049 aa  181  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 1114 aa  179  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 1177 aa  177  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1047 aa  174  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1105 aa  174  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  23.57 
 
 		 1024 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 1164 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1062 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1076 aa  172  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  22.19 
 
 		 1143 aa  171  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 1146 aa  171  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  22.87 
 
 		 1177 aa  170  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 1050 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1023 aa  169  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1076 aa  168  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 1042 aa  167  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 993 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  23.31 
 
 		 1102 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  22.44 
 
 		 1139 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  22.82 
 
 		 1124 aa  166  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 1142 aa  166  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 1131 aa  164  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  23.14 
 
 		 1097 aa  164  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 1028 aa  164  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 1038 aa  164  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1155 aa  163  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 1008 aa  162  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  24.28 
 
 		 1002 aa  161  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  23.94 
 
 		 1099 aa  161  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 1064 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 1060 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>