More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1354 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1230 aa  2515    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1199 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1181 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1175 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 1190 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1187 aa  549  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1096 aa  544  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 1189 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1203 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1085 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1161 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1185 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1198 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1218 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1205 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1202 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1204 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  28.41 
 
 		 1211 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1229 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1198 aa  326  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1101 aa  307  7e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1150 aa  288  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1129 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1132 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1154 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1219 aa  275  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1062 aa  254  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1124 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 1220 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  25.52 
 
 		 1237 aa  240  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1106 aa  238  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1152 aa  227  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1177 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1219 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 1109 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.11 
 
 		 1111 aa  220  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1120 aa  217  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 1003 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1127 aa  217  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1117 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 1128 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 1059 aa  214  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 1154 aa  213  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 1131 aa  212  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  22.73 
 
 		 1119 aa  212  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  22.53 
 
 		 1146 aa  211  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 1137 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1138 aa  210  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1161 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 1008 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1169 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 989 aa  199  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1105 aa  198  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 		 1109 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 		 1173 aa  195  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 		 1103 aa  195  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 1062 aa  194  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 1010 aa  194  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 1155 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 		 1155 aa  194  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1198 aa  193  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1027 aa  193  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1077 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.56 
 
 		 1041 aa  190  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1139 aa  189  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1051 aa  188  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 1026 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 1139 aa  184  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1116 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1047 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 1135 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1123 aa  183  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1127 aa  181  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1039 aa  181  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 1089 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1029 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1154 aa  178  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 1113 aa  178  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  24.27 
 
 		 1019 aa  177  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 994 aa  177  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 1051 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  22.7 
 
 		 1114 aa  176  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 		 1028 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1071 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1192 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1127 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 1086 aa  174  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  23.34 
 
 		 1081 aa  174  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  22.04 
 
 		 1070 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 		 1103 aa  174  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.82 
 
 		 1147 aa  174  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 1021 aa  173  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  23.5 
 
 		 1038 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 1050 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  23.77 
 
 		 925 aa  171  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 1004 aa  171  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 1036 aa  169  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1148 aa  169  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 1094 aa  168  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1143 aa  167  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>