More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1991 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1187 aa  2419    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  37.77 
 
 		 1190 aa  726    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 1181 aa  680    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1175 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1199 aa  612  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  36.39 
 
 		 1096 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1230 aa  546  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1085 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1203 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1161 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1198 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  28.58 
 
 		 1189 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1204 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 1185 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1218 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1205 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1202 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1198 aa  360  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1229 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 		 1211 aa  346  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1219 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1101 aa  277  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1220 aa  267  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1132 aa  267  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1177 aa  267  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1219 aa  257  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1131 aa  255  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1139 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 1150 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 1111 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1086 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1154 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 1128 aa  241  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1119 aa  237  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1146 aa  230  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1136 aa  224  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1164 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 		 1237 aa  222  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1116 aa  222  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1135 aa  221  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1102 aa  218  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 1144 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1012 aa  214  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1023 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1138 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 1114 aa  210  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 1192 aa  209  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 1076 aa  208  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 1181 aa  207  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 1066 aa  206  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1003 aa  205  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1137 aa  204  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1101 aa  204  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 1175 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1039 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1037 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1146 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1006 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1153 aa  201  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1028 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  22.62 
 
 		 1173 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1127 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1010 aa  198  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1029 aa  197  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1026 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1040 aa  194  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1012 aa  194  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 1017 aa  193  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1143 aa  192  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 1129 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1113 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1148 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 993 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 994 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1077 aa  188  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 1103 aa  187  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1124 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1023 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1084 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1033 aa  183  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1060 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 1028 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 1036 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1047 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 1026 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 1130 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1137 aa  178  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1023 aa  177  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  22.72 
 
 		 1164 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 1047 aa  177  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1160 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 1142 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  22.96 
 
 		 1129 aa  176  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1163 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  33.58 
 
 		 1127 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1037 aa  175  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  23.09 
 
 		 1148 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 1066 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 1063 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 1021 aa  172  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>