More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2451 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  48.38 
 
 		 1051 aa  926    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  53.85 
 
 		 1147 aa  1115    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  40.27 
 
 		 1032 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  45.89 
 
 		 1135 aa  848    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 		 1033 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  41.34 
 
 		 1063 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  38.31 
 
 		 1138 aa  744    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  37.2 
 
 		 1165 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  80.61 
 
 		 1142 aa  1905    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  44.41 
 
 		 1022 aa  794    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1153 aa  2345    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  37.22 
 
 		 1038 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 		 1036 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 1043 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1074 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 1059 aa  572  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  36.5 
 
 		 1073 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1129 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  36.53 
 
 		 1028 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.27 
 
 		 1058 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1031 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 1051 aa  516  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 1059 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 1105 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.32 
 
 		 1065 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1065 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 1166 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 1063 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1163 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1041 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1169 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1040 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1127 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1093 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1038 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1186 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1043 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1033 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 1098 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1059 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1102 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1067 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 1234 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.03 
 
 		 1010 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1071 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 1078 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  32.38 
 
 		 1083 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1189 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1072 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1087 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1068 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1115 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 1050 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1153 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1137 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1081 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1011 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.36 
 
 		 1071 aa  416  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1101 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1138 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1088 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1008 aa  409  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1073 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1098 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1099 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1081 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1107 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1047 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1064 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1081 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 1039 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1071 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.94 
 
 		 1025 aa  379  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1027 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1044 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1097 aa  347  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1155 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1176 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1084 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1122 aa  333  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1128 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1057 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1116 aa  314  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1177 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1114 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1088 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 1037 aa  302  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1124 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 1014 aa  294  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 999 aa  294  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1120 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1177 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 982 aa  291  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1116 aa  290  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1179 aa  289  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1161 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 996 aa  288  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1066 aa  287  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1132 aa  283  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1102 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>