More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1097 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1164 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1148 aa  2362    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3288  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1128 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0970492  hitchhiker  0.00551669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1010 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1119 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1124 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1120 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1143 aa  285  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 1043 aa  284  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1097 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1114 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1023 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1076 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1161 aa  277  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 1038 aa  274  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1076 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 989 aa  273  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1038 aa  273  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1128 aa  273  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1181 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1137 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1168 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1027 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1070 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1155 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 1035 aa  268  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 1177 aa  267  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 992 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 1014 aa  265  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1155 aa  265  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1028 aa  264  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 1122 aa  264  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 1059 aa  264  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1076 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1059 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 1130 aa  258  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1103 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1102 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 1026 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1173 aa  253  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1132 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1079 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1119 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1168 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1177 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 996 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1102 aa  248  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1125 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1053 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1062 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1129 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  24.3 
 
 		 925 aa  245  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1164 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1117 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 1037 aa  244  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 		 1080 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1116 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1019 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1006 aa  241  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1177 aa  240  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1106 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1012 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 1030 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1017 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1152 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1021 aa  238  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1081 aa  237  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1043 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 996 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 982 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1096 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 1000 aa  235  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1049 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1023 aa  234  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1051 aa  234  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 993 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1163 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1013 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1127 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1006 aa  232  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 1096 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1047 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1198 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1050 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1175 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1029 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1039 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24.81 
 
 		 1146 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1008 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1117 aa  228  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1142 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1139 aa  226  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1189 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1050 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1137 aa  224  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 1047 aa  224  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1147 aa  224  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  24.9 
 
 		 1023 aa  224  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1119 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 1079 aa  221  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>