More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3960 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  40.57 
 
 		 1063 aa  725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  48.63 
 
 		 1051 aa  933    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  40.35 
 
 		 1032 aa  720    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  44.49 
 
 		 1022 aa  791    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  44.62 
 
 		 1135 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 1138 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 1033 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  37.01 
 
 		 1165 aa  693    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1142 aa  2311    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  80.61 
 
 		 1153 aa  1927    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  58.55 
 
 		 1147 aa  1135    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  38.09 
 
 		 1038 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  37.39 
 
 		 1036 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  35.94 
 
 		 1043 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  36.87 
 
 		 1059 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1074 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  36.45 
 
 		 1073 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1129 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.88 
 
 		 1028 aa  533  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1063 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.67 
 
 		 1058 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 1105 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 1031 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.46 
 
 		 1065 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1166 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.9 
 
 		 1065 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1169 aa  506  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1051 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1127 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1163 aa  493  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1059 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1041 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1040 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1038 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.27 
 
 		 1059 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1043 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1186 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1189 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 1093 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 1098 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 1234 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.23 
 
 		 1010 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1033 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1067 aa  445  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 1078 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1068 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1071 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1102 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.74 
 
 		 1083 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1087 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1153 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1011 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 1050 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1072 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1081 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1088 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1081 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1073 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1115 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 1137 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1101 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  31.1 
 
 		 1071 aa  412  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1008 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1064 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1099 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1107 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1081 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1098 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1138 aa  393  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1047 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1071 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1044 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1176 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 1039 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1155 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1097 aa  348  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.62 
 
 		 1025 aa  347  8e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1128 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1116 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1027 aa  334  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1084 aa  325  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1057 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1122 aa  318  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1120 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1088 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1124 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1116 aa  299  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1132 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1177 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1146 aa  297  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1148 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1027 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1114 aa  291  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 1043 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1161 aa  287  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1102 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1155 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 999 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1029 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1023 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>