More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6148 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1218 aa  2489    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  37.34 
 
 		 1203 aa  675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 1189 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1198 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 1181 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1161 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1175 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1185 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1199 aa  436  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 1190 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1096 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1230 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1187 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1205 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1198 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1229 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1085 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1204 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  28.16 
 
 		 1211 aa  353  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1202 aa  337  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1136 aa  334  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1219 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 1111 aa  318  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 1237 aa  310  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1219 aa  307  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1101 aa  302  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1137 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1125 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1114 aa  269  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1043 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1152 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1181 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1114 aa  258  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1220 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1008 aa  255  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1027 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1160 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 1003 aa  251  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 1014 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1117 aa  247  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1028 aa  247  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1177 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1154 aa  246  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 1037 aa  244  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1023 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1096 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 979 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.06 
 
 		 1019 aa  241  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 982 aa  241  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1155 aa  241  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1023 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1006 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 994 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.08 
 
 		 1024 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 996 aa  237  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 1161 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 999 aa  234  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1132 aa  234  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 986 aa  234  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1076 aa  234  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1047 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1076 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1023 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 1096 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1150 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1120 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  24.85 
 
 		 925 aa  230  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1081 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 994 aa  229  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1062 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 1038 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1076 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1102 aa  228  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1202 aa  228  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1084 aa  227  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 993 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1106 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1116 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1087 aa  226  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1029 aa  225  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 996 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1155 aa  224  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 1175 aa  224  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 1177 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 1124 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1109 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1109 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1082 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 1080 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 1028 aa  218  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 996 aa  217  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1144 aa  217  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 989 aa  216  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  23.6 
 
 		 1063 aa  216  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 1063 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1117 aa  214  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1006 aa  214  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1051 aa  214  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1127 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1128 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>