More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0950 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1199 aa  2435    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 1181 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  39.82 
 
 		 1096 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  39.62 
 
 		 1175 aa  763    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  36.63 
 
 		 1190 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1230 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1187 aa  612  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1085 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1203 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1205 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1161 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 1189 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1218 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1204 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1198 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1229 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 1185 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1202 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1198 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 1211 aa  351  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1219 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1101 aa  310  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1132 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 1111 aa  275  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1220 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1154 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  23.38 
 
 		 1237 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1219 aa  251  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1143 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1160 aa  241  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 1144 aa  237  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1135 aa  234  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1109 aa  233  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  39.63 
 
 		 1127 aa  230  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 1122 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  36.13 
 
 		 1101 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1102 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1038 aa  224  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1113 aa  224  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  36.24 
 
 		 1138 aa  221  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  38.23 
 
 		 1166 aa  221  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1114 aa  216  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1131 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 979 aa  214  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1119 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1028 aa  211  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1136 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1047 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1037 aa  208  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 1163 aa  207  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1006 aa  205  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  35.84 
 
 		 1150 aa  205  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 1094 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1034 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1146 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 1146 aa  201  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  36.12 
 
 		 1127 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.95 
 
 		 1019 aa  199  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1017 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1116 aa  198  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 1152 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  35.43 
 
 		 894 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1127 aa  194  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 1119 aa  194  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 1169 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1076 aa  193  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1003 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1164 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 1154 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1109 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1129 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 1028 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1037 aa  185  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  23.18 
 
 		 1018 aa  184  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1109 aa  183  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 1051 aa  182  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1089 aa  181  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1105 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1049 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1012 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 996 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1124 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1138 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1139 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1086 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1154 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1077 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1109 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  23.17 
 
 		 1021 aa  169  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1033 aa  168  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 1139 aa  168  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 1140 aa  168  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1053 aa  167  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  23.98 
 
 		 1041 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 1063 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1123 aa  166  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1089 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 1158 aa  164  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1102 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 1047 aa  164  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>