More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2244 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  94.53 
 
 		 1027 aa  1911    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  46.18 
 
 		 1029 aa  880    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  46.21 
 
 		 1018 aa  872    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1109 aa  2259    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  35.04 
 
 		 1123 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1145 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  36.72 
 
 		 1036 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1006 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 		 1094 aa  562  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1056 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1148 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1127 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1176 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1130 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 913 aa  493  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1033 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 953 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1144 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1086 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 1056 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1033 aa  466  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1079 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1068 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 1045 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1046 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 937 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1056 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1131 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 1086 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1062 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1095 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1155 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1038 aa  443  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1025 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1061 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1128 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1138 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1148 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 929 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1139 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1081 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1146 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1047 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1026 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1036 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1124 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1116 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1043 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1164 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1020 aa  406  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 1130 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1031 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 1026 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 1128 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1168 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1129 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1060 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1161 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1142 aa  380  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 1150 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1132 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1116 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1074 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1065 aa  365  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1154 aa  361  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1039 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 1189 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1217 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 1049 aa  357  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1202 aa  357  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1192 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1093 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 1140 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 917 aa  349  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1102 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1173 aa  346  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1190 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1152 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1097 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1019 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1066 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1029 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1128 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1188 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1012 aa  338  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1011 aa  338  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1024 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1010 aa  337  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1038 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1161 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1020 aa  334  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1079 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1008 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1058 aa  333  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1004 aa  331  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 1041 aa  330  9e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1071 aa  330  9e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1164 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1042 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>