More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0666 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  42.01 
 
 		 1211 aa  841    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  40.92 
 
 		 1229 aa  841    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1101 aa  2283    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1161 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1198 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 1185 aa  354  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 		 1111 aa  333  9e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1204 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1203 aa  327  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 1181 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1175 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1189 aa  310  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1199 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1230 aa  307  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1190 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1218 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1096 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1205 aa  287  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1187 aa  277  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1136 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1202 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1219 aa  251  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1119 aa  247  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1023 aa  244  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1135 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 1219 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1034 aa  238  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1027 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  24.89 
 
 		 1035 aa  229  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 1085 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1114 aa  227  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 1043 aa  226  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1198 aa  224  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1084 aa  224  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 1110 aa  221  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1220 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 979 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1018 aa  216  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  23.58 
 
 		 1237 aa  215  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1160 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 1051 aa  212  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1017 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 		 1120 aa  211  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1040 aa  211  8e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1047 aa  210  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1041 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  24.51 
 
 		 1080 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1177 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 1105 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 1063 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 1014 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1125 aa  204  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1099 aa  204  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  23.06 
 
 		 1021 aa  203  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 1050 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1026 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 1096 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1152 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 1060 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 1012 aa  199  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 		 1020 aa  198  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 1158 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 1013 aa  196  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1028 aa  196  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 1168 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 1076 aa  194  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 1049 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 1051 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1076 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 1006 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 1029 aa  192  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 1059 aa  192  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1124 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 		 1064 aa  189  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 1039 aa  189  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1094 aa  187  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1087 aa  188  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 1144 aa  184  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 1011 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 1003 aa  182  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 1037 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 1057 aa  181  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 1045 aa  181  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1116 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  24.5 
 
 		 1017 aa  177  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 1038 aa  177  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 		 1010 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1036 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  22.8 
 
 		 1095 aa  176  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 1034 aa  175  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  21.86 
 
 		 1048 aa  172  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1116 aa  171  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1048 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1188 aa  169  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 1086 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1037 aa  167  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1103 aa  167  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 1061 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1161 aa  164  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 1055 aa  161  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>