More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2810 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  37.33 
 
 		 1058 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1048 aa  2123    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1042 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 1123 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1033 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1095 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1079 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1046 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1095 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1026 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1056 aa  334  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 1026 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 1011 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1168 aa  327  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1147 aa  324  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1020 aa  325  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1028 aa  323  7e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1013 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1036 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1047 aa  321  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 1086 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1034 aa  319  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1019 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1127 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1144 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.58 
 
 		 1037 aa  314  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1128 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1177 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1031 aa  310  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1161 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1124 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1066 aa  308  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1029 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1006 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1025 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1096 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1034 aa  305  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1027 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1036 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.84 
 
 		 1041 aa  303  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1163 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 1080 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1116 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1097 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1029 aa  301  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1128 aa  300  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.78 
 
 		 1043 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1083 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1132 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1064 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 989 aa  298  5e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1023 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1060 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1131 aa  296  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 1038 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1036 aa  296  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 1061 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1036 aa  295  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1071 aa  294  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1039 aa  294  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1152 aa  294  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1114 aa  294  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 996 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1024 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1148 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1109 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1130 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 994 aa  292  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1164 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1065 aa  291  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 1063 aa  290  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.82 
 
 		 1024 aa  289  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1031 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1138 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1010 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1042 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 986 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1102 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 1033 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1077 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1148 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1017 aa  287  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1077 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1116 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1023 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1103 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1049 aa  284  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1006 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 1034 aa  284  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1137 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1142 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 1018 aa  282  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1084 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 996 aa  281  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1043 aa  281  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1006 aa  281  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1128 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  26.64 
 
 		 1030 aa  280  7e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1172 aa  280  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>