More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5342 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  41.77 
 
 		 1189 aa  856    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  37.34 
 
 		 1218 aa  675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  43.66 
 
 		 1198 aa  932    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1203 aa  2459    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 1181 aa  552  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1161 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1199 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1229 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 1190 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1175 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1187 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1230 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1202 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1185 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1205 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1204 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 1198 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1096 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 1211 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1219 aa  357  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1220 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1219 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1135 aa  347  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1136 aa  331  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1101 aa  327  6e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 		 1237 aa  324  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1150 aa  310  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1116 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1062 aa  300  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1154 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1154 aa  298  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1102 aa  297  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1114 aa  295  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1119 aa  291  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1085 aa  291  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1006 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 1111 aa  288  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1124 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1086 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1132 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1138 aa  274  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1152 aa  270  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1164 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1163 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1027 aa  265  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1101 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  25.35 
 
 		 925 aa  258  5e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1181 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1127 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 1154 aa  248  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1160 aa  248  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1028 aa  248  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1092 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 997 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1043 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1051 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 1168 aa  241  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 994 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 1071 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 1094 aa  234  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1023 aa  234  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 		 1017 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1131 aa  227  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1063 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1006 aa  224  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1028 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.24 
 
 		 1080 aa  223  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1101 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1137 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1021 aa  222  3.9999999999999997e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 992 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 1081 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1139 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 1106 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1105 aa  218  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 1080 aa  217  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 996 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 		 1008 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 1009 aa  209  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 1003 aa  207  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 1023 aa  205  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1039 aa  205  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 		 1059 aa  205  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 1140 aa  204  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1006 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1037 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 1144 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1113 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 994 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1076 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 1147 aa  199  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1198 aa  199  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 1014 aa  198  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1076 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1050 aa  198  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1040 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 988 aa  195  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 996 aa  195  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 1158 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1012 aa  193  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>