More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0905 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 		 1175 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1199 aa  705    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 1190 aa  807    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1181 aa  2383    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  36.34 
 
 		 1187 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1230 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1096 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1203 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 1189 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1218 aa  469  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1229 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1204 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1085 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1161 aa  443  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 1185 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1205 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1198 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1202 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1198 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 		 1211 aa  387  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1101 aa  331  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1219 aa  327  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1220 aa  327  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 		 1111 aa  318  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1132 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1146 aa  290  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1135 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1158 aa  282  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1219 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1143 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  26.31 
 
 		 1237 aa  271  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1062 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1138 aa  267  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1086 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1114 aa  255  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1037 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1127 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1124 aa  254  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1077 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1150 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 1154 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1119 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1136 aa  246  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1027 aa  242  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1160 aa  242  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1163 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 1177 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1010 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1155 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 1128 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1050 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1131 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1037 aa  229  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1146 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 1173 aa  227  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 1106 aa  222  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1023 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 999 aa  221  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1039 aa  221  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 1161 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1177 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1181 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 1164 aa  218  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  23.66 
 
 		 1109 aa  218  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1192 aa  217  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1116 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  36.32 
 
 		 1101 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  34.79 
 
 		 1113 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  37.6 
 
 		 1169 aa  214  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 		 1116 aa  212  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1050 aa  211  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1079 aa  211  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 1147 aa  210  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1021 aa  207  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  23.77 
 
 		 1122 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 1103 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3288  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1128 aa  206  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0970492  hitchhiker  0.00551669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1119 aa  206  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1123 aa  206  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 979 aa  205  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1139 aa  204  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1047 aa  203  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1152 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1042 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 1129 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 1127 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1109 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 1008 aa  199  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 1014 aa  199  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  23.19 
 
 		 1172 aa  199  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  25.11 
 
 		 1024 aa  198  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1038 aa  198  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1043 aa  197  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 996 aa  197  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1011 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 1003 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1036 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 1004 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 1025 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 		 1114 aa  196  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>