More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1734 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  42.88 
 
 		 1237 aa  897    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  57.26 
 
 		 1219 aa  1269    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  61.6 
 
 		 1119 aa  1311    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1136 aa  2325    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  44.12 
 
 		 1114 aa  928    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  72.92 
 
 		 1219 aa  1640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  58.26 
 
 		 1135 aa  1283    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  29.09 
 
 		 1111 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1220 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1218 aa  334  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1203 aa  331  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1006 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1161 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 1189 aa  298  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 1154 aa  292  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1010 aa  291  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1114 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1185 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 1043 aa  284  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1198 aa  284  8.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1062 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1198 aa  280  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 1014 aa  280  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1041 aa  277  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1117 aa  273  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1160 aa  271  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1053 aa  270  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 996 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1202 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1029 aa  267  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1155 aa  266  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1079 aa  264  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 1144 aa  264  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 1211 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1084 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1051 aa  262  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1101 aa  261  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 997 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1128 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1064 aa  257  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1012 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1102 aa  254  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  25.68 
 
 		 925 aa  254  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1132 aa  254  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1154 aa  252  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  24.91 
 
 		 1018 aa  252  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.73 
 
 		 1080 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1175 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 989 aa  248  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1017 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 1181 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1181 aa  247  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1024 aa  246  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1023 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 996 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1122 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1076 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1006 aa  241  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.36 
 
 		 1041 aa  239  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 1062 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 1034 aa  238  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 1080 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1039 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 1004 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1137 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1066 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1006 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 1140 aa  234  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 1105 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  25.25 
 
 		 1035 aa  231  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1031 aa  231  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 1124 aa  231  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 1204 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1023 aa  231  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  24.74 
 
 		 1023 aa  230  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1034 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 1190 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1096 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  24.56 
 
 		 1019 aa  229  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  25.37 
 
 		 1082 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1050 aa  228  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  25.12 
 
 		 1085 aa  227  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1003 aa  227  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 984 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1047 aa  226  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1148 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1086 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 1187 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 1150 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 1005 aa  224  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1079 aa  224  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 1026 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 1094 aa  223  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 1229 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1205 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1173 aa  218  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1060 aa  218  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1109 aa  218  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 1063 aa  218  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  24.05 
 
 		 1047 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>