More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3996 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  52.75 
 
 		 1205 aa  1228    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1204 aa  2442    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1161 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1181 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 1190 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1199 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1187 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1203 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1229 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1230 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 		 1211 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1185 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1218 aa  356  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1175 aa  346  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1219 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1198 aa  343  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 1198 aa  340  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1096 aa  337  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1202 aa  335  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1101 aa  328  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1189 aa  302  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1132 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 1111 aa  273  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1085 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1219 aa  261  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 1140 aa  260  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1077 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1135 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  40.79 
 
 		 1146 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 1220 aa  246  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1154 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1139 aa  243  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1113 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1154 aa  240  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  35.99 
 
 		 1138 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1190 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 1237 aa  232  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 1136 aa  231  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1119 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1109 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1047 aa  221  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1155 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1114 aa  219  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1163 aa  218  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 1090 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1122 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1150 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 		 1094 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1101 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1131 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 1120 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 1094 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1148 aa  207  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1079 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1123 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 1154 aa  207  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1130 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 971 aa  205  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 1144 aa  205  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1023 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  32.81 
 
 		 1169 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1114 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1175 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1017 aa  201  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1034 aa  201  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 1164 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1173 aa  197  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 1028 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1086 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1050 aa  195  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1043 aa  195  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 1014 aa  195  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1049 aa  194  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1105 aa  194  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1043 aa  194  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1040 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 1055 aa  194  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1076 aa  192  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1202 aa  192  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1096 aa  192  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 996 aa  191  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1143 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1089 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1051 aa  188  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 1036 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1066 aa  185  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 1127 aa  184  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1124 aa  184  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 1080 aa  183  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 1025 aa  183  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1152 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1079 aa  181  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1192 aa  181  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1023 aa  181  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 1080 aa  181  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1031 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1039 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1127 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 1063 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1172 aa  178  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>