More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1074 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  37.77 
 
 		 1187 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  37.07 
 
 		 1175 aa  684    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  41.78 
 
 		 1181 aa  810    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  36.63 
 
 		 1199 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1190 aa  2406    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  39.49 
 
 		 1096 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1230 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1085 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1203 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1204 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1218 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1161 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1189 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1198 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 1185 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1205 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1229 aa  355  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1202 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  26.74 
 
 		 1211 aa  335  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1198 aa  325  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1101 aa  302  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1220 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 1132 aa  281  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1146 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1219 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 		 1111 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1131 aa  234  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 1160 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1127 aa  232  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1219 aa  231  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1136 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 1119 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1135 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  23.82 
 
 		 1237 aa  214  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 994 aa  214  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1138 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 1114 aa  213  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 1089 aa  211  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1139 aa  211  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 1155 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 986 aa  208  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 999 aa  208  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1038 aa  204  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1087 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 1043 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1028 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 979 aa  202  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1086 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 1164 aa  201  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  23.16 
 
 		 1129 aa  199  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1113 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 1017 aa  198  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1062 aa  196  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1128 aa  194  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1109 aa  194  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1124 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 1154 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3288  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1128 aa  191  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0970492  hitchhiker  0.00551669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  22.81 
 
 		 1168 aa  191  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1006 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 1177 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1154 aa  188  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1140 aa  188  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 		 1146 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1037 aa  186  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  23.12 
 
 		 1119 aa  185  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1163 aa  184  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 1192 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 1023 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1047 aa  182  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 1144 aa  182  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1114 aa  181  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  23.35 
 
 		 1021 aa  180  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 1080 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  22.9 
 
 		 1094 aa  181  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1113 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 992 aa  177  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 1076 aa  177  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 1025 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1102 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 1023 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1043 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 989 aa  175  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1190 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1127 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1169 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1076 aa  174  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1042 aa  174  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  24.84 
 
 		 1035 aa  173  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 1008 aa  173  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 1177 aa  173  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 1063 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1018 aa  171  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1042 aa  171  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  24.44 
 
 		 1019 aa  170  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1029 aa  170  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 1059 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 1012 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 1034 aa  168  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1049 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>