More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4184 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  43.56 
 
 		 1057 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  65.44 
 
 		 1038 aa  1438    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  38.48 
 
 		 1129 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  45.68 
 
 		 1037 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1042 aa  2132    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  35.09 
 
 		 1087 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1106 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 993 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1013 aa  526  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1146 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1017 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1034 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 979 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 1147 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 1050 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1006 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1096 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1038 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1048 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 1037 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1102 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1076 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1177 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1066 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 996 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1076 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1042 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1132 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1144 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1161 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 986 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1155 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1077 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1051 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1168 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1008 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1181 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1050 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1122 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1155 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1023 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1105 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1008 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1128 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1076 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1027 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1079 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1029 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1038 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 1030 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  30.19 
 
 		 1034 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.88 
 
 		 1041 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1006 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 994 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1079 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1006 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1058 aa  380  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 1026 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1028 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1152 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1039 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1023 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 996 aa  370  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 1000 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1060 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1075 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1059 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1148 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1085 aa  363  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1106 aa  363  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1039 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 1071 aa  361  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1012 aa  360  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1116 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1154 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 982 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1117 aa  356  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 		 1063 aa  355  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1064 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1043 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  26.76 
 
 		 1018 aa  350  8e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1124 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1023 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1173 aa  348  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1053 aa  347  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 989 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1096 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1127 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1034 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1163 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1081 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1119 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1188 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1114 aa  344  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1140 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1010 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1010 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1071 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 1128 aa  342  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1020 aa  341  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>