More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1259 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1106 aa  2257    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 1033 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  36.06 
 
 		 986 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1102 aa  539  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 1144 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1006 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1077 aa  459  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1096 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1177 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1017 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1155 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 1008 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1071 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 993 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1106 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1042 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1087 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1039 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1105 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1006 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1114 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 979 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1012 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 996 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1161 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1147 aa  383  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1013 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 1029 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1066 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1038 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  28.49 
 
 		 1030 aa  376  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1181 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1168 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1148 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1050 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1076 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1079 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1122 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1008 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1064 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 1034 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1028 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1124 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1132 aa  364  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1063 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1037 aa  363  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 1071 aa  362  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1037 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1038 aa  360  9e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1081 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1173 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1023 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 1034 aa  358  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 		 1063 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1154 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1060 aa  356  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1042 aa  355  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1155 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 		 1129 aa  354  5e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 1011 aa  353  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1058 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1010 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1053 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.11 
 
 		 1080 aa  349  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1000 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 1023 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 1025 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1023 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1079 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1050 aa  344  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1076 aa  344  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1128 aa  343  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1138 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1075 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 1026 aa  341  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1038 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1152 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1097 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1189 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 982 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 989 aa  337  7e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1036 aa  337  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 		 1043 aa  337  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1047 aa  335  2e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1059 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1051 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1164 aa  335  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1127 aa  334  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1041 aa  334  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 1041 aa  334  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1048 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1039 aa  332  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1027 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1051 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1040 aa  330  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1076 aa  330  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 996 aa  327  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1116 aa  327  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1006 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>