More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2221 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1079 aa  2202    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1010 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 989 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1117 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1161 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 1037 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 982 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1177 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 986 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 1043 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1114 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1038 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1129 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1116 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1132 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 999 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1059 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1021 aa  393  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1023 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1173 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1019 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1096 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.56 
 
 		 1024 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.18 
 
 		 1041 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1027 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 1050 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1008 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1155 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1051 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1012 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1051 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1039 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 1140 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 1000 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1181 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1066 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1071 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1152 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 1154 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.5 
 
 		 1019 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1028 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1079 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 1023 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 994 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1029 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1014 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 996 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1006 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1154 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1028 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1155 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1128 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1198 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 1063 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1103 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1150 aa  366  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 1071 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1120 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1023 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1079 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1122 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1163 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1124 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1053 aa  354  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 1041 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  27.59 
 
 		 1063 aa  350  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  29.38 
 
 		 925 aa  348  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1017 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1043 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1164 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1148 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1039 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1076 aa  345  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1080 aa  345  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1062 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1076 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 1020 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 1080 aa  342  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1147 aa  342  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1076 aa  341  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1102 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 1038 aa  340  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1006 aa  340  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1154 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1066 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1026 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1023 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1070 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1144 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1006 aa  334  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  27.96 
 
 		 1002 aa  333  8e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1049 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1137 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1075 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1096 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1097 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 1035 aa  325  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 1003 aa  324  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1085 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1119 aa  323  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>