More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6682 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1085 aa  2187    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1781  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1055 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1181 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1066 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 1037 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 1043 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1161 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1155 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 1014 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1027 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.46 
 
 		 1041 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1008 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1029 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 986 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1075 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1114 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1038 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 982 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1177 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1012 aa  353  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1039 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1006 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 989 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1071 aa  348  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1039 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1043 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 1059 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  27.59 
 
 		 1024 aa  342  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1013 aa  340  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1154 aa  340  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1023 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1050 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  27.48 
 
 		 1063 aa  337  7.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 1071 aa  336  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1040 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1079 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1163 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1028 aa  334  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1023 aa  333  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.08 
 
 		 1019 aa  333  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 992 aa  333  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1026 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1034 aa  330  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 1028 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 1140 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1117 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1124 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1148 aa  327  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1070 aa  327  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1128 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 999 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1053 aa  323  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1049 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1051 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1010 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1006 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 1043 aa  322  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1020 aa  320  7e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 1047 aa  320  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 997 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1120 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1102 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1059 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1147 aa  317  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1020 aa  316  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 		 1023 aa  315  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1168 aa  314  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1017 aa  314  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1116 aa  314  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1031 aa  313  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1137 aa  313  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1122 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1021 aa  311  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1132 aa  311  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1051 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1066 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 1144 aa  310  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 994 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 986 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1019 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1036 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1154 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 1038 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1152 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1058 aa  307  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1060 aa  307  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1003 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1064 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1085 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1080 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 994 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1071 aa  305  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1154 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1006 aa  304  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1172 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1076 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1006 aa  304  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 996 aa  303  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 1065 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 979 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>