More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1781 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1781  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1055 aa  2140    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1085 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1038 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1161 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 994 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1037 aa  311  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 1059 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1028 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1080 aa  304  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 996 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1008 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1071 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 1019 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1039 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1014 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1070 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 1029 aa  292  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1777  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 966 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1049 aa  287  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1079 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 1043 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1012 aa  286  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27 
 
 		 1041 aa  284  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1155 aa  284  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1122 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1010 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  27.81 
 
 		 1063 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 999 aa  281  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 1181 aa  281  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1114 aa  280  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 996 aa  278  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1051 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1120 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1023 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1117 aa  270  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1132 aa  269  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1168 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1062 aa  267  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 982 aa  267  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1017 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 1000 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1043 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 1071 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1147 aa  265  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1143 aa  264  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 989 aa  264  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1096 aa  264  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1124 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1051 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 1063 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1023 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1154 aa  260  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 1034 aa  260  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1042 aa  260  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1034 aa  260  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1006 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1129 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1081 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1066 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1053 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1006 aa  259  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 992 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 1030 aa  257  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1150 aa  257  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1013 aa  257  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1177 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1039 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1082 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1155 aa  255  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1116 aa  254  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1050 aa  254  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1020 aa  253  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1064 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1021 aa  248  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1060 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 1026 aa  247  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1060 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1071 aa  247  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1049 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1031 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1027 aa  247  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1066 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1023 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1040 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1128 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 1033 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 1065 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 1038 aa  244  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1023 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  24.81 
 
 		 1024 aa  244  9e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1154 aa  244  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1075 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1040 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  25.67 
 
 		 986 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 1031 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 1177 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1139 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1198 aa  241  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.26 
 
 		 1111 aa  241  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 1105 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>