More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1022 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1094 aa  2243    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  39.25 
 
 		 1036 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.5 
 
 		 1006 aa  582  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1109 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  35.61 
 
 		 1027 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 1018 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1029 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1123 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 1056 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1130 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1145 aa  483  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 1144 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1038 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1095 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1068 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1095 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 1086 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1033 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 1081 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1079 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 1033 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1127 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 937 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1046 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1086 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1061 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1148 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1176 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1130 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 953 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1047 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1036 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1043 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 913 aa  390  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1146 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1062 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 1045 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1019 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1045 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1013 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1025 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1056 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1026 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1038 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1155 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 1050 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1051 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1066 aa  360  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1164 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1074 aa  357  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1116 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1026 aa  354  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1034 aa  353  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1188 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 989 aa  351  4e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1031 aa  350  6e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 1037 aa  350  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1217 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1139 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 929 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1008 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 1029 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1055 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1128 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 1071 aa  338  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1028 aa  337  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 1128 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1132 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1079 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 996 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 982 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1064 aa  330  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1138 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1038 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1036 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 1041 aa  327  8.000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 1024 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1124 aa  324  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1058 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 1093 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1148 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1062 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1006 aa  322  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1119 aa  321  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 986 aa  320  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1052 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1128 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1010 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1139 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1148 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  26.13 
 
 		 1080 aa  317  9e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1152 aa  317  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1042 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1147 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 1063 aa  314  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1192 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1034 aa  310  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1097 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1021 aa  305  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1066 aa  305  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>