More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3406 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1006 aa  2046    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  44.33 
 
 		 1123 aa  842    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1130 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1043 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1036 aa  582  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1094 aa  582  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1068 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1109 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  36.93 
 
 		 1062 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  35.32 
 
 		 1033 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 937 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1027 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1018 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 1081 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1029 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 1086 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1176 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 1033 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 1056 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 953 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1148 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1056 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1145 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 1045 aa  503  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 1086 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1079 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1046 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1095 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 913 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1056 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1095 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 1061 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1038 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 1144 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 1025 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1047 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 929 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 1036 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 1026 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1127 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1026 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1038 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1130 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1128 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1013 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1155 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1020 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 1065 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1161 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1142 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1146 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1128 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1034 aa  372  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1138 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1074 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 1020 aa  360  7e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1019 aa  357  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 1093 aa  355  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1168 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1164 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1060 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 1011 aa  350  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1077 aa  350  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1050 aa  348  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1131 aa  347  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1053 aa  347  8.999999999999999e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1010 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1139 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1052 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1128 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1100 aa  341  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 989 aa  337  7e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1148 aa  337  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1024 aa  337  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1036 aa  337  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1045 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1188 aa  335  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1037 aa  333  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1104 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1066 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  27.28 
 
 		 1041 aa  332  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1036 aa  331  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1217 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1000 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1004 aa  329  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1071 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1029 aa  327  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1117 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1116 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1164 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1028 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1129 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1051 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1055 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 994 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 917 aa  322  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1006 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1082 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1190 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1062 aa  317  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>