More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5521 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  51.13 
 
 		 1033 aa  997    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 		 1068 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1130 aa  2297    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1006 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1123 aa  628  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  37.44 
 
 		 1062 aa  625  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1176 aa  622  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1148 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 1081 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1086 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1043 aa  560  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1056 aa  562  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1109 aa  499  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1018 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1036 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 1144 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1145 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 1061 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1094 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1029 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1027 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 1056 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 1033 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 1045 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 1056 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1046 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1127 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1079 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1131 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 1086 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 953 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 913 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 937 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1146 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1036 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1142 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 1026 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1020 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 1038 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1128 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1026 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1188 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1095 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1128 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1095 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1047 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1155 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 1130 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1217 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1025 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1138 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1019 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1065 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1163 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1152 aa  357  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1037 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1128 aa  354  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1192 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1132 aa  346  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1031 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1053 aa  344  4e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1168 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1114 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1117 aa  340  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 929 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1181 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1034 aa  333  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1161 aa  333  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1139 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1036 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1055 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1079 aa  327  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1074 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1085 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 1006 aa  324  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1052 aa  323  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 1049 aa  323  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 1093 aa  322  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1029 aa  322  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1139 aa  321  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1039 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1144 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1116 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1177 aa  318  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1096 aa  317  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1129 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1102 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1179 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 1033 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 989 aa  314  6.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1071 aa  313  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1060 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1161 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 1050 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1020 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1147 aa  307  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1096 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 1128 aa  305  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1202 aa  305  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>