More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5835 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  51.13 
 
 		 1130 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1033 aa  2112    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1062 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 1081 aa  602  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  35.65 
 
 		 1176 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  36.29 
 
 		 1056 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  35.06 
 
 		 1068 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1006 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  34.34 
 
 		 1123 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1148 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1043 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  33.83 
 
 		 1086 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1027 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1109 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1029 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1036 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1094 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1018 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  32.3 
 
 		 1045 aa  433  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1056 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 1033 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1145 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1079 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 1061 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 937 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 953 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1056 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1046 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1086 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 1144 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 913 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1095 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1019 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1026 aa  357  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1127 aa  356  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1155 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1128 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1047 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1095 aa  344  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1020 aa  344  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1036 aa  340  7e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1038 aa  340  7e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1026 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1036 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1146 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1128 aa  327  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1163 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 1025 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1013 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1116 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1168 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1130 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1074 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1139 aa  313  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1138 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1034 aa  309  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1161 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1053 aa  307  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1124 aa  306  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 929 aa  303  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 1037 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 1093 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1059 aa  298  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1142 aa  297  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1177 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1039 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1192 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1139 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1075 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1006 aa  287  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1050 aa  287  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 		 1043 aa  287  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1137 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 917 aa  285  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1060 aa  284  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1084 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1077 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1104 aa  282  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1217 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 1080 aa  280  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1179 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1029 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1055 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1011 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1114 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1116 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1164 aa  278  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1147 aa  277  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1096 aa  277  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1148 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1181 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 1041 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1152 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 986 aa  274  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1147 aa  274  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 1033 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1096 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.73 
 
 		 1041 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1064 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1052 aa  271  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>