More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2226 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1117 aa  2279    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1070 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  35.4 
 
 		 1143 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 		 1059 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1099 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1110 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1128 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1117 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1181 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 1043 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 1037 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1155 aa  370  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1038 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 1038 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1120 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1168 aa  357  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1060 aa  357  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 1050 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1079 aa  354  5e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1129 aa  353  8e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1051 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1066 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1132 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1029 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1161 aa  350  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 994 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1053 aa  344  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1017 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1168 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1064 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1082 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1062 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1102 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 979 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1034 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1010 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1155 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1177 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1027 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 1071 aa  333  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 999 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1063 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1000 aa  332  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 1026 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 1014 aa  330  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1105 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 996 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1043 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1037 aa  327  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1020 aa  327  6e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1106 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1085 aa  327  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1028 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1062 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 1023 aa  325  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1049 aa  323  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1042 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1173 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1036 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 1080 aa  323  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1076 aa  321  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1023 aa  320  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1051 aa  320  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1148 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1122 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1096 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1128 aa  318  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.93 
 
 		 1024 aa  316  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1071 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1076 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 986 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1076 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1043 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1006 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1152 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 1034 aa  314  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1084 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1179 aa  310  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 1189 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1039 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1006 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1021 aa  309  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1117 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 1175 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1147 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1023 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1144 aa  304  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1202 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 1164 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1012 aa  301  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1139 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  26.58 
 
 		 1019 aa  300  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 1063 aa  300  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 996 aa  298  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1053 aa  298  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 1010 aa  297  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1075 aa  297  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6682  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1085 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1038 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1128 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>