More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0560 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  58.14 
 
 		 996 aa  1142    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 971 aa  1959    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  72.77 
 
 		 1102 aa  1437    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  38.13 
 
 		 999 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  35.39 
 
 		 971 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  36.91 
 
 		 1103 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 1094 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  35.31 
 
 		 1125 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 		 1119 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1137 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  33.1 
 
 		 1005 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 1003 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1047 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 1090 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1023 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1114 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1124 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1025 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 982 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 1161 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1053 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 1037 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 1004 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 1094 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1122 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1066 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1155 aa  363  9e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1128 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1129 aa  361  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1051 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1023 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1117 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 984 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 1029 aa  357  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1181 aa  357  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.61 
 
 		 1063 aa  356  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1177 aa  356  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1037 aa  353  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1097 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1014 aa  353  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1076 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1164 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1049 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1012 aa  350  7e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 994 aa  350  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 		 986 aa  349  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 1010 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 1038 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 975 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 996 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1076 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 1080 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1027 aa  346  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.25 
 
 		 1023 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1006 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1031 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1079 aa  344  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1028 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 976 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1051 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 1128 aa  342  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1113 aa  340  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1006 aa  340  7e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 979 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1079 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 1000 aa  338  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1010 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1071 aa  337  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1026 aa  337  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  28.46 
 
 		 925 aa  335  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1148 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1012 aa  334  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1026 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1116 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1127 aa  332  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1041 aa  330  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1021 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 989 aa  325  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1163 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 1047 aa  324  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 1063 aa  324  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1155 aa  324  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1102 aa  323  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1058 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1177 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 977 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1006 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1080 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1017 aa  322  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1014 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1036 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1043 aa  321  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 1011 aa  320  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1103 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.12 
 
 		 1041 aa  320  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1179 aa  320  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 1008 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1050 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1039 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>