More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4505 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1046 aa  2095    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  46.09 
 
 		 1040 aa  904    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1161 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1088 aa  361  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 986 aa  354  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 1050 aa  347  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1008 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1064 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1006 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 982 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 1078 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.3 
 
 		 1041 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1176 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1101 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1044 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1014 aa  337  7.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1027 aa  337  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1128 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1011 aa  337  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 989 aa  335  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1023 aa  335  4e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 994 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 1071 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 1063 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1039 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 996 aa  330  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1124 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1037 aa  327  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 1039 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1076 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1076 aa  324  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  28.87 
 
 		 977 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1173 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 1029 aa  320  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1038 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1116 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1021 aa  317  8e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1040 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1102 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1177 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1155 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 998 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1047 aa  314  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1066 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1066 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1028 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1148 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 986 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1010 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1152 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1147 aa  307  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1012 aa  306  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1059 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1097 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 1043 aa  302  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1122 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1051 aa  300  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1068 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1169 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1132 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1051 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1075 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1016 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1012 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 1038 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1127 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1142 aa  294  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.21 
 
 		 1019 aa  293  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1163 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1181 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.25 
 
 		 1039 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1155 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1137 aa  293  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1144 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1096 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 1034 aa  292  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1019 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1172 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  27.68 
 
 		 1028 aa  290  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1043 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1189 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1063 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1079 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1071 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1059 aa  287  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1153 aa  287  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  28.48 
 
 		 1024 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1076 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1129 aa  284  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1079 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 996 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 1105 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1137 aa  282  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 1003 aa  281  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1038 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1036 aa  281  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 986 aa  281  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 999 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1129 aa  280  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1023 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>