More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2624 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  37.74 
 
 		 1065 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  35.38 
 
 		 1058 aa  646    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 		 1105 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 1093 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1051 aa  2141    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  44.45 
 
 		 1059 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 		 1059 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  35.85 
 
 		 1028 aa  578  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 1234 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  34.11 
 
 		 1074 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 1031 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1043 aa  556  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  35.52 
 
 		 1081 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1115 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1087 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1127 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  33.93 
 
 		 1071 aa  526  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  35.26 
 
 		 1063 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1040 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1047 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1073 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1063 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  34.98 
 
 		 1153 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1081 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 		 1059 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 1166 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1147 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  34.42 
 
 		 1081 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1064 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1135 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1033 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32.97 
 
 		 1065 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1142 aa  504  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1129 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1071 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  33.42 
 
 		 1071 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 1073 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1038 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1038 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1138 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1165 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1022 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1101 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  33.93 
 
 		 1051 aa  478  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1043 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  33.47 
 
 		 1137 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 1050 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1189 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 1072 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1068 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1163 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1033 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1102 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 1078 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1169 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1186 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  31.53 
 
 		 1032 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1088 aa  445  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 1083 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 1039 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1044 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1098 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 		 1088 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1107 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1041 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1067 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1138 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1084 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  30.28 
 
 		 1010 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1099 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1011 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 1098 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1176 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1153 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1008 aa  364  4e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1027 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1057 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1116 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.27 
 
 		 1025 aa  350  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1027 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1023 aa  312  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1161 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 		 1038 aa  288  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1039 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1079 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1053 aa  281  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1124 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1155 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1010 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 1037 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1046 aa  277  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 1050 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 996 aa  271  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1051 aa  270  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1082 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 1029 aa  267  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1023 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1181 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1014 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>