More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3959 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1044 aa  2130    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  49.81 
 
 
1050 aa  991    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 
1039 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 
1078 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 
1059 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 
1011 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 
1040 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 
1105 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 
1189 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  31.24 
 
 
1101 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 
1051 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 
1071 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 
1038 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 
1065 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 
1047 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 
1088 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 
1081 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 
1093 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 
1064 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.77 
 
 
1028 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  30.24 
 
 
1058 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 
1027 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 
1081 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  30.29 
 
 
1065 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 
1074 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 
1063 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 
1138 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 
1166 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 
1059 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 
1043 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 
1063 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 
1038 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 
1073 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 
1073 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 
1127 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 
1142 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 
1135 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 
1068 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 
1059 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 
1102 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 
1031 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  28.2 
 
 
1071 aa  363  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 
1153 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 
1176 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 
1129 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 
1165 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 
1036 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 
1087 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 
1043 aa  352  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 
1147 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 
1137 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 
1163 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 
1022 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 
1081 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 
1084 aa  350  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
1234 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 
1098 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 
1169 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 
1072 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 
1099 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 
1115 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 
1046 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 
1033 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 
1033 aa  334  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  28.25 
 
 
1032 aa  330  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 
1051 aa  329  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.37 
 
 
1083 aa  328  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 
1023 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 
1088 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 
1071 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.19 
 
 
1010 aa  321  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 
1107 aa  321  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 
1186 aa  321  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
1037 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 
1027 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 
1138 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.16 
 
 
1025 aa  315  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 
1041 aa  313  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 
1098 aa  307  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 
1051 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 
1153 aa  300  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 
1008 aa  295  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 
1040 aa  293  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 
1014 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 
1038 aa  290  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 
1010 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 
1006 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 
1161 aa  288  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 
1008 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
982 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 
1129 aa  285  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 
1116 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
1029 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 
999 aa  282  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 
989 aa  280  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 
1057 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 
1155 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 
1120 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 
1067 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 
1066 aa  274  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>