More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6808 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  46.02 
 
 		 1046 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1040 aa  2107    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1161 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1008 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1006 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1038 aa  350  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1128 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 1037 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1124 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 982 aa  337  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 1050 aa  337  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 986 aa  336  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1066 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 986 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1016 aa  331  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 1029 aa  330  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 989 aa  328  3e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1011 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.6 
 
 		 1063 aa  328  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1023 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1028 aa  327  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  29.18 
 
 		 977 aa  325  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1114 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1010 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1155 aa  323  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1176 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 1071 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 1041 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 1039 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1173 aa  317  8e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1116 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 996 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1066 aa  315  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1181 aa  314  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 998 aa  313  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1039 aa  313  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1071 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1040 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1152 aa  311  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1070 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1148 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1027 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 1078 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1147 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1043 aa  303  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1079 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 1014 aa  303  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1085 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1038 aa  300  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1079 aa  300  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1177 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1198 aa  297  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 1065 aa  294  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1023 aa  294  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 1019 aa  293  8e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1079 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 984 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1023 aa  291  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1101 aa  291  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 1050 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1039 aa  290  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1064 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 979 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1103 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1071 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1000 aa  288  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1063 aa  287  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1012 aa  286  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 1043 aa  285  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  28.56 
 
 		 1047 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1044 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1051 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1129 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 999 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1043 aa  281  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5532  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1092 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0182385  normal  0.924407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1051 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1140 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1177 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 		 1047 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1129 aa  274  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1119 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1153 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1012 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1142 aa  271  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 		 1028 aa  271  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1047 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 1144 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1043 aa  269  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1189 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1058 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1013 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 994 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1027 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1063 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1163 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1150 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1031 aa  265  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1071 aa  264  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1154 aa  264  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>