More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4238 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  45.84 
 
 		 1081 aa  855    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  42.66 
 
 		 1189 aa  798    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1101 aa  2213    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  37.74 
 
 		 1064 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  37.26 
 
 		 1047 aa  621  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  34.17 
 
 		 1040 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1071 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1059 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1068 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 1050 aa  492  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1051 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1078 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  32.4 
 
 		 1058 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1065 aa  462  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  32.02 
 
 		 1028 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1059 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 1039 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 1105 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1087 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1063 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1129 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1081 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1044 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1074 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1138 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1165 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1043 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1088 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1153 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1073 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 1166 aa  413  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1102 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1142 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1059 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1031 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1011 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1127 aa  403  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1135 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1038 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1071 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1072 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 1234 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1033 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1093 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1147 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1186 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1022 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1081 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1073 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1033 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1027 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1043 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  28.9 
 
 		 1071 aa  379  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 1036 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1137 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1107 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1163 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1115 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  28.92 
 
 		 1065 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1176 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.4 
 
 		 1032 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1084 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1099 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1098 aa  353  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1169 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1088 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1057 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1041 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1138 aa  332  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 1051 aa  330  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 		 1083 aa  328  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.2 
 
 		 1025 aa  327  6e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1067 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1116 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1046 aa  314  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1085 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1161 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1040 aa  283  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1014 aa  268  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1038 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1117 aa  263  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1010 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1181 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1177 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1028 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1043 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1037 aa  257  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1155 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1173 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1063 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1129 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1038 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1076 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  27.56 
 
 		 977 aa  246  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1071 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1155 aa  245  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 999 aa  244  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1021 aa  244  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>