More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3367 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1033 aa  2105    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  52.57 
 
 		 1043 aa  1117    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  37.19 
 
 		 1059 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 1105 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  34.91 
 
 		 1065 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  35.08 
 
 		 1074 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  36.15 
 
 		 1028 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 1166 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  36.06 
 
 		 1059 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.68 
 
 		 1051 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  32.65 
 
 		 1058 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1022 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1129 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1135 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 		 1031 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 		 1138 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 1093 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1038 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  33.94 
 
 		 1051 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1153 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1063 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32.56 
 
 		 1065 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 		 1147 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1142 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1040 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1063 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  32.67 
 
 		 1071 aa  459  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1059 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1081 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1165 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1071 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1072 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1087 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  30.42 
 
 		 1032 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1073 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1064 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1127 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1102 aa  423  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1047 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1068 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 1078 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1189 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1067 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 1234 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1038 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1081 aa  406  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1101 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 1098 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1081 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1036 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1043 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1115 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1041 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1073 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1186 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1071 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1169 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  30.04 
 
 		 1010 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.88 
 
 		 1025 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1099 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1137 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1033 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1039 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.89 
 
 		 1083 aa  370  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.18 
 
 		 1011 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1153 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1088 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 1098 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1163 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1107 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 1050 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1008 aa  345  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1088 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 1044 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1138 aa  321  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1027 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1084 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1116 aa  308  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1176 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1057 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1014 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 962 aa  249  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1027 aa  247  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1040 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1077 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1066 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1132 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1152 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 1029 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1163 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1102 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1051 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1173 aa  228  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1155 aa  228  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.43 
 
 		 1049 aa  227  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1023 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1023 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1124 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 1008 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1038 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>