More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4562 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  37.22 
 
 		 1067 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1065 aa  2159    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  36.22 
 
 		 1135 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  37.7 
 
 		 1022 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  36.3 
 
 		 1063 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  34.85 
 
 		 1032 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.54 
 
 		 1058 aa  554  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1065 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  36.23 
 
 		 1147 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1059 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  34.73 
 
 		 1028 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.49 
 
 		 1093 aa  529  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 1105 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  34.33 
 
 		 1138 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1074 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1040 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  33.45 
 
 		 1071 aa  514  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1036 aa  512  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1059 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 		 1043 aa  512  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1142 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1153 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1051 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1166 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1063 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1038 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1073 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1165 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  33.06 
 
 		 1051 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.85 
 
 		 1010 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1038 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 1098 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1043 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1033 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1129 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1073 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 1033 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  32.55 
 
 		 1031 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  32.91 
 
 		 1083 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1059 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1081 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1087 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 1078 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1088 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 1163 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1064 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1169 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 1234 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1072 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1127 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  31.79 
 
 		 1102 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1081 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1041 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1153 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1099 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  30.52 
 
 		 1025 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1039 aa  413  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 1050 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1047 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1137 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1071 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1186 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1068 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 		 1115 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1071 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1044 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1107 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 1081 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1189 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1011 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1008 aa  383  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1088 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1101 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1098 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1138 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1027 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1057 aa  330  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1084 aa  327  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1116 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1053 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1176 aa  273  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 989 aa  267  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1040 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 1096 aa  254  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1028 aa  254  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1155 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1037 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  23.9 
 
 		 1018 aa  248  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 962 aa  248  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 986 aa  245  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 986 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1127 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1008 aa  241  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1046 aa  241  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1066 aa  241  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 979 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1079 aa  240  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 1035 aa  239  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 1038 aa  237  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1102 aa  231  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>