More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3040 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1107 aa  2236    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  39.25 
 
 		 1102 aa  764    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  75.07 
 
 		 1099 aa  1697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  39.27 
 
 		 1186 aa  780    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.81 
 
 		 1058 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1065 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1059 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1072 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1127 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1051 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1135 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1073 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1074 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1022 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1142 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 1068 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1059 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1153 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 1065 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1071 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1147 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1059 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 1028 aa  383  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1234 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 1038 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 1105 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1031 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1129 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1081 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1043 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 1093 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1137 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1101 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 1073 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1038 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 1032 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1138 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 1098 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1165 aa  360  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1115 aa  360  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1033 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.04 
 
 		 1081 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 1166 aa  353  8e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1163 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1063 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1043 aa  350  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1078 aa  350  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 1051 aa  347  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1087 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 1041 aa  344  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1036 aa  341  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1033 aa  341  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1064 aa  341  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.91 
 
 		 1083 aa  340  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1050 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1047 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1071 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 1010 aa  327  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1040 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1153 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1169 aa  320  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 1039 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.43 
 
 		 1025 aa  315  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1098 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1044 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1189 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1008 aa  300  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1088 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  27.81 
 
 		 1071 aa  293  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 1050 aa  291  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1011 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1057 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 1176 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 1138 aa  283  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1088 aa  283  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1067 aa  270  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 1014 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1039 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1062 aa  239  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1132 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1154 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1051 aa  230  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1120 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1177 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1070 aa  226  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 997 aa  225  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1122 aa  224  6e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1066 aa  221  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 1026 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1049 aa  221  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  25.16 
 
 		 1177 aa  218  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1076 aa  217  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1053 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 1140 aa  214  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 1076 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1034 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1168 aa  208  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1012 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 1135 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1063 aa  205  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>