More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0967 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  39.17 
 
 
1071 aa  753    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  40.18 
 
 
1065 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  37.41 
 
 
1058 aa  675    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  43.96 
 
 
1059 aa  812    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  70.09 
 
 
1105 aa  1559    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1093 aa  2227    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  39 
 
 
1051 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 
1081 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 
1169 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 
1040 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 
1074 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  37.05 
 
 
1028 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  36.1 
 
 
1059 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 
1166 aa  569  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 
1081 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 
1038 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 
1088 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 
1163 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  36.91 
 
 
1022 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 
1063 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 
1087 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  35.39 
 
 
1135 aa  536  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 
1234 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  34.95 
 
 
1031 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  34.31 
 
 
1065 aa  522  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.25 
 
 
1137 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  35.74 
 
 
1115 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 
1138 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1047 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  34.22 
 
 
1098 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 
1165 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 
1129 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  34.39 
 
 
1051 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 
1059 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 
1147 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 
1063 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  31.94 
 
 
1138 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 
1073 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  33.69 
 
 
1073 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 
1098 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  34.46 
 
 
1083 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 
1033 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 
1068 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 
1050 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  33.92 
 
 
1153 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 
1064 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 
1043 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 
1071 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 
1078 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 
1038 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 
1127 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 
1071 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1072 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 
1057 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 
1142 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  32.11 
 
 
1010 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  33.48 
 
 
1043 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 
1153 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 
1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 
1081 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 
1067 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 
1036 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 
1032 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 
1041 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 
1033 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 
1039 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 
1116 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 
1102 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 
1011 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 
1044 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 
1088 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 
1008 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 
1101 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 
1186 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 
1084 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 
1107 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 
1099 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  29.85 
 
 
1025 aa  354  5.9999999999999994e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 
1027 aa  343  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 
1176 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 
1038 aa  257  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 
1132 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 
1038 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 
1051 aa  243  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 
1079 aa  240  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 
1046 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
1050 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 
1039 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 
1154 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 
1021 aa  230  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 
1041 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 
1181 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 
1066 aa  224  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 
1120 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 
1161 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
1037 aa  222  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
1140 aa  220  8.999999999999998e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 
1147 aa  220  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 
1173 aa  218  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 
1071 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>