More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6791 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1138 aa  2336    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  39.05 
 
 
1057 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 
1116 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
1105 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 
1059 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 
1093 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  30.31 
 
 
1071 aa  470  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  32.22 
 
 
1058 aa  463  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 
1137 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 
1115 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 
1081 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 
1065 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 
1153 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 
1135 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
1163 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 
1033 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 
1051 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 
1059 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 
1028 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 
1127 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 
1142 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 
1022 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 
1078 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 
1169 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 
1129 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 
1234 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 
1040 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
1166 aa  383  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 
1071 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 
1165 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 
1063 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 
1068 aa  380  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 
1088 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 
1072 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 
1087 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 
1038 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 
1189 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 
1038 aa  364  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 
1098 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 
1036 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
1081 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 
1138 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 
1063 aa  357  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 
1098 aa  355  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  29.5 
 
 
1065 aa  353  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 
1073 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 
1083 aa  352  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 
1147 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
1050 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 
1031 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 
1081 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
1039 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 
1043 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 
1153 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.54 
 
 
1032 aa  338  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 
1059 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 
1073 aa  334  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 
1074 aa  332  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 
1101 aa  332  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.93 
 
 
1025 aa  330  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.78 
 
 
1051 aa  325  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 
1102 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 
1071 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 
1047 aa  317  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 
1043 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 
1041 aa  314  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 
1044 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 
1010 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 
1033 aa  307  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 
1186 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
1067 aa  295  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 
1064 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 
1008 aa  291  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 
1176 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 
1084 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 
1011 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 
1107 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 
1099 aa  281  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 
1027 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 
1088 aa  258  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 
1124 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 
962 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  23.9 
 
 
1155 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 
1116 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 
1070 aa  207  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
1189 aa  205  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  23.47 
 
 
1177 aa  204  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 
1113 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  25.22 
 
 
1096 aa  197  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 
1181 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 
1027 aa  191  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 
1132 aa  191  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 
1038 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
1140 aa  190  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 
1079 aa  190  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 
1155 aa  189  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  22.13 
 
 
1097 aa  188  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  22.5 
 
 
1128 aa  188  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 
979 aa  187  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 
1122 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>