More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5278 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  55.98 
 
 
1088 aa  1152    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1163 aa  2373    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  52.5 
 
 
1169 aa  1211    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 
1105 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 
1093 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 
1059 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  34.16 
 
 
1071 aa  523  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 
1153 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  32.83 
 
 
1081 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 
1065 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 
1135 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.44 
 
 
1142 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 
1138 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  32.77 
 
 
1058 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 
1051 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 
1165 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 
1063 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 
1022 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 
1028 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 
1074 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 
1147 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 
1063 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32.19 
 
 
1065 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 
1059 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 
1234 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 
1038 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 
1041 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 
1031 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 
1098 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
1166 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 
1040 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 
1043 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 
1068 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 
1059 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 
1071 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 
1073 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 
1057 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 
1038 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 
1127 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
1138 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 
1137 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 
1129 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.94 
 
 
1083 aa  396  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 
1043 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 
1102 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 
1050 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 
1047 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 
1081 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.45 
 
 
1032 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 
1087 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 
1073 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 
1115 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  30.63 
 
 
1051 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 
1081 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 
1186 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 
1033 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 
1078 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 
1067 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 
1036 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 
1101 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 
1189 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 
1116 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 
1098 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 
1071 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 
1107 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 
1064 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 
1099 aa  348  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 
1072 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 
1153 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 
1033 aa  339  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 
1044 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  31.11 
 
 
1025 aa  329  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 
1011 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 
1010 aa  326  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 
1176 aa  318  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 
1008 aa  315  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
1039 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 
1027 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 
1088 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 
1084 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 
1161 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 
1038 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 
1040 aa  235  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
1043 aa  234  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 
1046 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
1028 aa  229  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 
1114 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 
1120 aa  224  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
1154 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 
1038 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 
962 aa  219  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 
1181 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 
1119 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
996 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 
1177 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
1000 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 
1155 aa  216  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 
1050 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 
1080 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.06 
 
 
1117 aa  215  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>