More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1897 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  39.25 
 
 		 1107 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1102 aa  2249    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  39.25 
 
 		 1099 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  46.42 
 
 		 1186 aa  947    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1059 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.67 
 
 		 1028 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1127 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1105 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  31.81 
 
 		 1051 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1153 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1038 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 		 1058 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1081 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1234 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1135 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1063 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1031 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 1142 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  31.47 
 
 		 1147 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1065 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.85 
 
 		 1065 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.61 
 
 		 1129 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1093 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1087 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 		 1033 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1073 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 1074 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1033 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1043 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1036 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1166 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1101 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1068 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1040 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1063 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1072 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1098 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  29.65 
 
 		 1064 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1081 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1059 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1071 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1163 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1022 aa  390  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  28.26 
 
 		 1051 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 1032 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 1059 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 1041 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1137 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 1010 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1043 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1047 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1038 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1073 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1115 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1050 aa  370  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.11 
 
 		 1083 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1078 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1153 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1165 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1044 aa  360  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1169 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  29.31 
 
 		 1071 aa  349  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1071 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1008 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1081 aa  340  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1088 aa  337  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1176 aa  330  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1098 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1088 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1138 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1067 aa  313  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1027 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1057 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1023 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1027 aa  278  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  26.9 
 
 		 1025 aa  276  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1138 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1116 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 1014 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1037 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 1050 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1120 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1040 aa  251  7e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1128 aa  250  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1079 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  26.41 
 
 		 1080 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1076 aa  245  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1053 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1049 aa  244  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 998 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1219 aa  244  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1076 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 989 aa  239  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1177 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 999 aa  234  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 997 aa  231  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1046 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 1059 aa  229  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1079 aa  229  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1148 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>