More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01945 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  100 
 
 		 977 aa  1966    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 998 aa  735    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  39.53 
 
 		 1016 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6126  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 986 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1161 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1006 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1038 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1040 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1008 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1124 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 982 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 1029 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.93 
 
 		 1041 aa  317  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 1037 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1046 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 1027 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1010 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 1038 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1023 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.5 
 
 		 1019 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 989 aa  303  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 986 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1066 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1028 aa  300  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1155 aa  300  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1050 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 1114 aa  298  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 1140 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1071 aa  294  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 999 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1128 aa  290  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1177 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 1071 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1088 aa  287  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1012 aa  285  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1120 aa  284  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1177 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1198 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 1019 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1006 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 994 aa  277  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1147 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 1103 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 1028 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  27.26 
 
 		 1028 aa  273  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1076 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 		 1079 aa  270  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 1050 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1011 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1155 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1039 aa  267  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1027 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1064 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 1116 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1086 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1039 aa  264  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1051 aa  263  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1013 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1102 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1017 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1101 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1039 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1040 aa  261  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 996 aa  260  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1078 aa  260  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1066 aa  260  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1096 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1096 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1173 aa  257  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1059 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1041 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 976 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 1035 aa  254  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  26.2 
 
 		 1018 aa  253  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 1040 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1070 aa  251  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1064 aa  250  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  27.78 
 
 		 925 aa  250  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1006 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1014 aa  249  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1038 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  26.42 
 
 		 1024 aa  247  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1026 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1085 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1079 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1065 aa  247  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  26.23 
 
 		 1080 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1081 aa  245  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1037 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 986 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1051 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.64 
 
 		 1023 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 992 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1122 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1068 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1023 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1127 aa  241  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1137 aa  240  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  25.36 
 
 		 1005 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  26.44 
 
 		 1071 aa  240  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>