More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0405 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 
1011 aa  2064    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 
1040 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 
1078 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 
1064 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 
1047 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 
1189 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 
1059 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 
1071 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 
1044 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 
1039 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 
1050 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 
1059 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 
1063 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 
1031 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 
1081 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 
1038 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 
1068 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  33.21 
 
 
1058 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 
1105 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.62 
 
 
1028 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 
1129 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 
1093 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 
1027 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 
1166 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 
1081 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 
1065 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 
1142 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 
1127 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.02 
 
 
1153 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 
1138 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 
1063 aa  413  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 
1074 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 
1101 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 
1073 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 
1036 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 
1038 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 
1073 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 
1083 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 
1043 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 
1059 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  30.16 
 
 
1022 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 
1051 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  29.53 
 
 
1065 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  30.37 
 
 
1010 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 
1165 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 
1088 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 
1043 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 
1098 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  28.9 
 
 
1071 aa  371  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 
1135 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 
1147 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  30.46 
 
 
1025 aa  365  3e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 
1032 aa  361  5e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 
1041 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  29.39 
 
 
1051 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
1153 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 
1087 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 
1033 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 
1033 aa  351  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 
1176 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 
1169 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 
1234 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 
1081 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 
1137 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 
1067 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 
1098 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 
1163 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 
1084 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 
1115 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 
1040 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 
1008 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 
1072 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 
1046 aa  314  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 
1037 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 
1057 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 
1029 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 
1071 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 
1023 aa  297  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 
1027 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 
1099 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 
1107 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
1014 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
1043 aa  287  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
996 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 
1088 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 
999 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 
1119 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 
1138 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 
1038 aa  283  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
1013 aa  283  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 
1102 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 
1155 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 
1006 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 
1021 aa  274  8.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 
986 aa  273  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.34 
 
 
1041 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
994 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 
1124 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 
1128 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 
986 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>